Skip to content

Latest commit

 

History

History
39 lines (36 loc) · 1.72 KB

cluster.md

File metadata and controls

39 lines (36 loc) · 1.72 KB
Raw

Настройка окружения

Загрузка компилятора intel2023, intelMPI, MKL

module load gcc-9.5.0
. /common/intel_oneapi/setvars.sh

Загрузка окружения для Galois

. /common/intel_oneapi/setvars.sh
conda activate /common/home/group/slasolver/soft/Galois/galois_env
export LD_LIBRARY_PATH=/common/home/group/slasolver/soft/Galois/galois_env/lib:$LD_LIBRARY_PATH

cmake v 3.20

export PATH=/common/home/group/slasolver/cmake-3.20.0/bin:$PATH

Папки

  • /common/home/group/slasolver/soft/ -- все софты
  • /common/home/group/slasolver/matrices -- некоторые матрицы
  • /common/home/group/slasolver/soft/Galois/build2 -- сборка Galois многопоточного
  • /common/home/group/slasolver/soft/Galois/build2/lonestar/analytics/cpu -- приложения многопоточные
  • /common/home/group/slasolver/soft/Galois/lonestar/analytics/distributed -- сборка Galois распределенного, приложения
  • /common/home/group/slasolver/soft/Galois/build2/tools/graph-convert -- конвертер

Примеры запуска Galois

конвертер

./graph-convert --edgelist2gr  --edgeType=void /common/home/group/slasolver/matrices/asia_osm.txt asia_osm2.gr

BFS

OPENMP_NUM_THREADS=8 srun -N 1 -p gpu -t 10 ./bfs-directionopt-cpu --startNode=1 /common/home/group/slasolver/soft/Galois/build2/tools/graph-convert/asia_osm2.gr

BFS distributed (2 процесса на 1м узле)

GALOIS_DO_NOT_BIND_THREADS=1 srun -N 1 -n 2 -p gpu -t 10 ./bfs-push-dist /common/home/group/slasolver/soft/Galois/build2/tools/graph-convert/asia_osm2.gr -t=1 -startNode=10 -partition=oec --runs=1