Skip to content

release-0611

Compare
Choose a tag to compare
@wishabc wishabc released this 06 Nov 11:59
· 1399 commits to master since this release
  1. Обновлена аннотация пиков

  2. Были учтены регионы с повторами: для common SNP (c rs ID) в соответствие ставился типа повтора (колонка repeat_type),
    non-rs снипы в повторах выкидывались

  3. Новая процедура подсчета плоидности (Отделен коллинг крупных делеций, штраф в делециях 1 - 10**(-1/SQRT(N)),
    штраф за границу - CAIC до 30к SNP, SQRT - после, состояния 1.5, 6)

  4. Раздельные эффект сайзы для ref и alt (колонки m1_ref, m1_alt, m2_ref, m2_alt, вместо m1, m2)

  5. m_callers теперь нет, есть total_callers и unique_callers

Новые данные на globe:/home/abramov/RESULTS/release-0611/