release-0611
-
Обновлена аннотация пиков
-
Были учтены регионы с повторами: для common SNP (c rs ID) в соответствие ставился типа повтора (колонка repeat_type),
non-rs снипы в повторах выкидывались -
Новая процедура подсчета плоидности (Отделен коллинг крупных делеций, штраф в делециях 1 - 10**(-1/SQRT(N)),
штраф за границу - CAIC до 30к SNP, SQRT - после, состояния 1.5, 6) -
Раздельные эффект сайзы для ref и alt (колонки m1_ref, m1_alt, m2_ref, m2_alt, вместо m1, m2)
-
m_callers теперь нет, есть total_callers и unique_callers
Новые данные на globe:/home/abramov/RESULTS/release-0611/