Skip to content

release-0412

Compare
Choose a tag to compare
@M1kss M1kss released this 04 Dec 17:17
· 1245 commits to master since this release
  1. Существенно доработана процедура оценки BAD: убраны snp с покрытием меньше 8, порог на выбор CAIC/SQRT - 1,5*10^7 по суммарному покрытию (включая выброшенные снипы), доп. состояния: BAD = 1.33, 1.5, 2.5, 6

  2. Масштабирование sBAD: 1->1, 1.33->1.5, 1.5->2, 2->3, 2.5->3, 3->4, 4->5, 5->6, 6->6

  3. Фильтр >=25 на максимальное покрытие при агрегации

  4. Три варианта подсчета p_value: старый, по бином. тестам, cor - по цензурированным и bal - по цензурированным и симметризованным, чтобы исключить наличе p_value = 1