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# VITH - Visualização Interativa de testes de hipótese
versao <- 1.1
# Pedro Diniz Guglielmeli
#- - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
# Esse Shiny App utiliza a licença GPLv3
#- - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
# Github: https://github.com/paulk2jonas/VITH
if (!require(shiny)) {
install.packages("shiny")
}
if (!require(ggplot2)) {
install.packages("ggplot2")
}
library(shiny)
library(ggplot2)
verm_escuro <- "#913A3C" # Zona de rejeição
verm_claro <- "#DE6F71" # Hipótese
amarelo <- "#DFDD4C" # p-value
azul_claro <- "#59ACDE" # Beta
azul_escuro <- "#417391" # Poder
ui <- fluidPage(
titlePanel("Visualização interativa de testes de hipótese"),
plotOutput(outputId = "plot"),
fluidRow(
column(
5,
# Média da hipótese nula
sliderInput(
inputId = "media_0",
label = "Média hipotética da população",
min = -5,
max = 5,
value = 0,
step = .1,
width = "100%"
),
# Média da hipótese alternativa
sliderInput(
inputId = "media_1",
label = "Média da população",
min = -5,
max = 5,
value = 3,
step = .1,
width = "100%"
),
# Desvio padrão
sliderInput(
inputId = "sd",
label = "Desvio padrão",
value = 1,
min = .5,
max = 2,
step = .1,
width = "100%"
)
),
column(
5,
# Nível de significância
sliderInput(
inputId = "alfa",
label = "Nível de significância",
min = 0,
max = 1,
value = .05,
step = .01,
width = "100%"
),
# Tipo de teste
selectInput(
inputId = "tipo_teste",
label = "Natureza do teste",
choices = c("À esquerda", "À direita", "Bilateral"),
selected = "À direita",
width = "100%"
),
# Insere o valor da estatística de teste
conditionalPanel(
condition = "input_p_ligado == true",
numericInput(
inputId = "estat_teste",
label = "Estatística de teste",
value = 2,
min = -10,
max = 10,
step = .01,
width = "100%"
)
)
),
column(
2,
wellPanel(
### Seleciona os gráficos
## Hipótese nula
p(strong("Hipótese nula")),
# Preenchimento
checkboxInput(
inputId = "p_h_nula",
label = "Preenchimento",
value = TRUE
),
# Curva
checkboxInput(
inputId = "c_h_nula",
label = "Curva",
value = TRUE
),
## Hipótese alternativa
p(strong("Hipótese alternativa")),
# Preenchimento
checkboxInput(
inputId = "p_h_alt",
label = "Preenchimento",
value = TRUE
),
# Curva
checkboxInput(
inputId = "c_h_alt",
label = "Curva",
value = TRUE
),
br(),
# Libera a utilização do p-value
checkboxInput(
inputId = "p_ligado",
label = "Inserir estatística de teste"
)
)
)
),
hr(),
fluidRow(
column(
4,
HTML('<a rel="license" href="https://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0.pt-br.html"><img alt="Licença GNU GLPv3" style="border-width:0" src="https://www.gnu.org/graphics/gplv3-with-text-84x42.png" /></a><br /><span xmlns:dct="http://purl.org/dc/terms/" property="dct:title">Visualização interativa de testes de hipótese</span> de <span xmlns:cc="http://creativecommons.org/ns#" property="cc:attributionName">Pedro Diniz Guglielmeli</span> está licenciado com uma Licença <a rel="license" href="https://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0.pt-br.html">GNU GLPv3</a>.')
),
column(
8,
p("Feito por Pedro Diniz Guglielmeli", align = "right"),
p(paste("Versão ", versao), align = "right"),
p(
a(
href = "https://github.com/paulk2jonas/VITH",
"Código fonte"
),
align = "right"
)
)
)
)
server <- function(input, output) {
# Cria os valores para o eixo x
eixo_x <- data.frame(x = c(-7, 7))
# Altera o alfa para a montagem do gráfico
alfa_1 <- reactive({
if (input$tipo_teste == "À esquerda") {
input$alfa
} else if (input$tipo_teste == "À direita") {
1 - input$alfa
} else if (input$tipo_teste == "Bilateral") {
input$alfa / 2
}
})
alfa_2 <- reactive(1 - input$alfa / 2)
# Cria o ponto crítico do teste
ponto_critico <- reactive(
qnorm(
p = alfa_1(),
mean = input$media_0,
sd = input$sd
)
)
ponto_critico_2 <- reactive(
qnorm(
p = alfa_2(),
mean = input$media_0,
sd = input$sd
)
)
## Cria os limites a serem usados pelo gráfico
# Limites para poder e área de rejeição em testes unilaterais,
# ou poder e área de rejeição à esquerda em testes bilaterais
pr <- reactive({
if (input$alfa == 0) {
c(NA, NA)
} else if (input$alfa == 1) {
if (input$tipo_teste == "Bilateral") {
c(-7, ponto_critico())
} else {
c(-7, 7)
}
} else {
if (input$tipo_teste == "À esquerda") {
c(-7, ponto_critico())
} else if (input$tipo_teste == "À direita") {
c(ponto_critico(), 7)
} else if (input$tipo_teste == "Bilateral") {
c(-7, ponto_critico())
}
}
})
# Limites para poder e área de rejeição à direita em testes bilaterais
pr_2 <- reactive({
if (input$tipo_teste == "À esquerda") {
c(NA, NA)
} else if (input$tipo_teste == "À direita") {
c(NA, NA)
} else if (input$tipo_teste == "Bilateral") {
c(ponto_critico_2(), 7)
}
})
# Limites para área beta e restante da hipótese nula
bh <- reactive({
if (input$alfa == 0) {
c(-7, 7)
} else if (input$alfa == 1) {
c(NA, NA)
} else {
if (input$tipo_teste == "À esquerda") {
c(ponto_critico(), 7)
} else if (input$tipo_teste == "À direita") {
c(-7, ponto_critico())
} else if (input$tipo_teste == "Bilateral") {
c(ponto_critico(), ponto_critico_2())
}
}
})
## Cria o gráfico da hipótese alternativa
# Cria a área de poder
poder <- reactive(
stat_function(
fun = dnorm,
args = list(
mean = input$media_1,
sd = input$sd
),
geom = "area",
xlim = pr(),
fill = azul_escuro,
alpha = .3
)
)
poder_2 <- reactive(
stat_function(
fun = dnorm,
args = list(
mean = input$media_1,
sd = input$sd
),
geom = "area",
xlim = pr_2(),
fill = azul_escuro,
alpha = .3
)
)
# Cria a área beta
area_beta <- reactive(
stat_function(
fun = dnorm,
args = list(
mean = input$media_1,
sd = input$sd
),
geom = "area",
xlim = bh(),
fill = azul_claro,
alpha = .3
)
)
# Cria o outline
curva_alt <- reactive(
stat_function(
fun = dnorm,
args = list(
mean = input$media_1,
sd = input$sd
),
size = .75,
col = azul_escuro
)
)
# Cria o gráfico da hipótese nula
# Cria a área de 1 - alfa
area_nula <- reactive(
stat_function(
fun = dnorm,
args = list(
mean = input$media_0,
sd = input$sd
),
geom = "area",
xlim = bh(),
fill = verm_claro,
alpha = .3
)
)
# Cria a área de rejeição
area_alfa <- reactive(
stat_function(
fun = dnorm,
args = list(
mean = input$media_0,
sd = input$sd
),
geom = "area",
xlim = pr(),
fill = verm_escuro,
alpha = .3
)
)
area_alfa_2 <- reactive(
stat_function(
fun = dnorm,
args = list(
mean = input$media_0,
sd = input$sd
),
geom = "area",
xlim = pr_2(),
fill = verm_escuro,
alpha = .3
)
)
# Cria o outline
curva_nula <- reactive(
stat_function(
fun = dnorm,
args = list(
mean = input$media_0,
sd = input$sd
),
size = .75,
col = verm_escuro
)
)
# Cria a camada do ponto crítico
pcritico <- reactive(
geom_point(
aes(
x = ponto_critico(),
y = 0
),
shape = 21,
fill = verm_escuro,
col = "white",
size = 4,
stroke = 2
)
)
pcritico_2 <- reactive(
geom_point(
aes(
x = ponto_critico_2(),
y = 0
),
shape = 21,
fill = verm_escuro,
col = "white",
size = 4,
stroke = 2
)
)
# Cria a área do p-value
xlim_p <- reactive({
if (input$tipo_teste == "À esquerda") {
c(-7, input$estat_teste)
} else if (input$tipo_teste == "À direita") {
c(input$estat_teste, 7)
} else if (input$tipo_teste == "Bilateral") {
x_1 <- input$media_0 - abs(abs(input$media_0) - abs(input$estat_teste))
c(-7, x_1)
}
})
xlim_p_2 <- reactive({
if (input$tipo_teste == "Bilateral") {
x_2 <- input$media_0 + abs(abs(input$media_0) - abs(input$estat_teste))
c(x_2, 7)
} else {
c(NA, NA)
}
})
area_p <- reactive(
stat_function(
fun = dnorm,
args = list(
mean = input$media_0,
sd = input$sd
),
geom = "area",
xlim = xlim_p(),
fill = amarelo,
alpha = .5
)
)
area_p_2 <- reactive(
stat_function(
fun = dnorm,
args = list(
mean = input$media_0,
sd = input$sd
),
geom = "area",
xlim = xlim_p_2(),
fill = amarelo,
alpha = .5
)
)
# Cria a camada da estatística de teste padronizada
pteste <- reactive(
geom_point(
aes(
x = input$estat_teste,
y = 0
),
shape = 21,
fill = amarelo,
col = "white",
size = 4,
stroke = 2
)
)
# Cria as "linhas críticas"
linha_critica <- reactive(geom_vline(aes(xintercept = ponto_critico())))
linha_critica_2 <- reactive(geom_vline(aes(xintercept = ponto_critico_2())))
## Dados relevantes
# Calcula os dados
alfa_t <- reactive(input$alfa)
beta_t <- reactive({
if (input$alfa == 0) {
1
} else if (input$alfa == 1) {
0
} else {
if (input $tipo_teste == "À esquerda") {
pnorm(
pr()[2],
mean = input$media_1,
sd = input$sd,
lower.tail = FALSE
)
} else if (input$tipo_teste == "À direita") {
pnorm(
pr()[1],
mean = input$media_1,
sd = input$sd
)
} else if (input$tipo_teste == "Bilateral") {
pnorm(
pr()[2],
mean = input$media_1,
sd = input$sd
) + pnorm( # ! Have to fix this crap
pr_2()[1],
mean = input$media_1,
sd = input$sd,
lower.tail = FALSE
)
}
}
})
poder_t <- reactive(1 - beta_t())
p_value_t <- reactive({
if (input $tipo_teste == "À esquerda") {
pnorm(
xlim_p()[2],
mean = input$media_0,
sd = input$sd
)
} else if (input$tipo_teste == "À direita") {
pnorm(
xlim_p()[1],
mean = input$media_0,
sd = input$sd,
lower.tail = FALSE
)
} else if (input$tipo_teste == "Bilateral") {
pnorm(
xlim_p()[2],
mean = input$media_0,
sd = input$sd
) + pnorm( # ! Fix this crap too
xlim_p_2()[1],
mean = input$media_0,
sd = input$sd,
lower.tail = FALSE
)
}
})
# Cria as camadas dos dados
alfa_t_g <- reactive(
annotate(
geom = "text",
x = -7,
y = .75,
label = bquote(
alpha == .(alfa_t()) # ? Why do I need this??
),
hjust = 0,
size = 7
)
)
beta_t_g <- reactive(
annotate(
geom = "text",
x = -7,
y = .68,
label = bquote(
beta == .(beta_t())
),
hjust = 0,
size = 7
)
)
poder_t_g <- reactive(
annotate(
geom = "text",
x = -7,
y = .61,
label = bquote(
Poder == .(poder_t())
),
hjust = 0,
size = 7
)
)
p_value_t_g <- reactive(
annotate(
geom = "text",
x = -7,
y = .54,
label = bquote(
Valor ~ p == .(p_value_t())
),
hjust = 0,
size = 7
)
)
# Plotagem de saída
output$plot <- renderPlot({
myplot <- ggplot(data = eixo_x, aes(x = .data[["x"]]))
# Plota as "linhas críticas"
if (input$tipo_teste == "Bilateral") {
myplot <- myplot + linha_critica() + linha_critica_2()
} else {
myplot <- myplot + linha_critica()
}
# Plota a área da hipótese alternativa
if (input$p_h_alt == TRUE) {
myplot <- myplot + poder() + poder_2() + area_beta()
}
# Plota a área da hipótese nula
if (input$p_h_nula == TRUE) {
myplot <- myplot + area_nula() + area_alfa() + area_alfa_2()
}
# Plota a área do p-value
if (input$p_ligado == TRUE) {
myplot <- myplot + area_p() + area_p_2()
}
## Plota as curvas de distribuição
# Curva da distribuição alternativa
if (input$c_h_alt == TRUE) {
myplot <- myplot + curva_alt()
}
# Curva da distribuição nula
if (input$c_h_nula == TRUE) {
myplot <- myplot + curva_nula()
}
# Plota o ponto da estatística de teste
if (input$p_ligado) myplot <- myplot + pteste()
# Plota os pontos críticos
if (input$tipo_teste == "Bilateral") {
myplot <- myplot + pcritico() + pcritico_2()
} else {
myplot <- myplot + pcritico()
}
# Plota os dados relevantes
if (input$p_ligado == TRUE) {
myplot <- myplot + alfa_t_g() + beta_t_g() + poder_t_g() + p_value_t_g()
} else {
myplot <- myplot + alfa_t_g() + beta_t_g() + poder_t_g()
}
# Plota o gráfico final
myplot +
coord_cartesian(xlim = c(-7, 7), ylim = c(0, .8)) +
theme_void() +
theme(
panel.background = element_rect(size = .5),
plot.margin = unit(c(0, 5, 15, 5), "pt")
)
})
}
shinyApp(ui = ui, server = server)