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├── data
│ ├── original
│ │ ├── HGG
│ │ │ ├── BraTS19_2013_2_1
│ │ │ │ ├── BraTS19_2013_2_1_flair.nii.gz
│ │ │ │ ├── BraTS19_2013_2_1_seg.nii.gz
│ │ │ │ ├── BraTS19_2013_2_1_t1ce.nii.gz
│ │ │ │ ├── BraTS19_2013_2_1_t1.nii.gz
│ │ │ │ └── BraTS19_2013_2_1_t2.nii.gz
│ │ │ └── ...
│ │ └── LGG
│ │ ├── BraTS19_2013_0_1
│ │ │ ├── BraTS19_2013_0_1_flair.nii.gz
│ │ │ ├── BraTS19_2013_0_1_seg.nii.gz
│ │ │ ├── BraTS19_2013_0_1_t1ce.nii.gz
│ │ │ ├── BraTS19_2013_0_1_t1.nii.gz
│ │ │ └── BraTS19_2013_0_1_t2.nii.gz
│ │ └── ...
│ ├── preprocessed
│ ├── preprocessed_val_data
│ ├── survival_data.csv
│ └── val_data
│ └── val
│ ├── BraTS19_CBICA_AAM_1
│ │ ├── BraTS19_CBICA_AAM_1_flair.nii.gz
│ │ ├── BraTS19_CBICA_AAM_1_t1ce.nii.gz
│ │ ├── BraTS19_CBICA_AAM_1_t1.nii.gz
│ │ └── BraTS19_CBICA_AAM_1_t2.nii.gz
│ ├── ...
│ └── survival_evaluation.csv
├── demo_task1
│ ├── cross_val.py
│ ├── data_for_val.py
│ ├── demo_run.ipynb
│ ├── draw_evaluation.py
│ ├── evaluate.py
│ ├── predict_model.py
│ ├── preprocess.py
│ ├── run_validation.py
│ └── train_model.py
├── demo_task2
│ ├── demo_run.ipynb
│ ├── preprocess.py
│ └── train_model.py
├── dev_tools
│ ├── __init__.py
│ └── my_tools.py
└── unet3d
├── augment.py
├── data.py
├── generator.py
├── __init__.py
├── metrics.py
├── model
│ ├── __init__.py
│ ├── isensee2017.py
│ └── unet.py
├── normalize.py
├── patches.py
├── prediction.py
├── training.py
└── utils.py