update

04_sesion1.Rmd

@@ -0,0 +1,13 @@
+# Creación de sitios web con pkgdown
+
+Erick Cuevas
+
+31 de octubre de 2024
+
+## Diapositivas
+
+[
+```{r,echo=FALSE}
+knitr::include_url("https://comunidadbioinfo.github.io/cdsb2023/Pruebas_04_sesion01.html", height = "380px")
+```
+](https://comunidadbioinfo.github.io/cdsb2023/Pruebas_04_sesion01.html)

05_sesion1.Rmd

@@ -0,0 +1,18 @@
+# Proyectos colaborativos
+
+## Propuesta 1
+
+
+## Propuesta 2
+
+
+## Propuesta 3
+
+
+## Propuesta 4
+
+
+## Propuesta 5
+
+
+

README.md

@@ -7,13 +7,13 @@
 Les damos la bienvenida al Workshop Desarrollo de paqueterías de R/Bioconductor! 
 
 <p align="justify">
-Estamos encantadxs de anunciar que la CDSB, junto con la Red Mexicana de Bioinformática (RMB) y el Nodo Nacional de Bioinformática en la UNAM (NNB-CCG), está organizando el taller Desarrollo de paqueterías de R/Bioconductor como parte del Encuentro Nacional de Bioinformática México 2024.
+Nos da gusto anunciar que la CDSB, junto con la Red Mexicana de Bioinformática (RMB) y el Nodo Nacional de Bioinformática en la UNAM (NNB-CCG), está organizando el taller Desarrollo de paqueterías de R/Bioconductor como parte del Encuentro Nacional de Bioinformática México 2024.
 
 Todas las sesiones serán teóricas y prácticas. Nos enfocaremos en dos temas principales: 
 </p>
 
-- Configuraciones avanzadas de flujos de trabajo
 - Creación de paquetes de R/Bioconductor
+- Generación de sitios web para la documentación de paquetes de R
 
 [**¡Registrate aquí!**](https://www.nnb.unam.mx/EBM2024/registro/)
 
@@ -24,34 +24,38 @@ Todas las sesiones serán teóricas y prácticas. Nos enfocaremos en dos temas p
 - [Dra. Mirna Vázquez Rosas Landa](https://comunidadbioinfo.github.io/es/authors/mirnavrl/): Investigadora en el Instituto de Ciencias de Mar y Limnología de la UNAM.
 - [Dra. Alejandra Medina Rivera](https://comunidadbioinfo.github.io/es/authors/amedina/): Investigadora Asociada en el Laboratorio Internacional de Investigación de Medicina Genómica, UNAM. 
 - [M.C. Erick Cuevas Fernández](https://comunidadbioinfo.github.io/es/authors/erickcufe/): Estudiante de Doctorado en la Universidad Nacional Autónoma de México.
+- [M.C. José Antonio Ovando Ricárdez](https://comunidadbioinfo.github.io/es/authors/joseovando/)
+
+## Ayudantes
+
+- Dra. Evelia Coss
 
 ## Temario 
 
 Consulta el calendario de este curso en: <http://bit.ly/calendarcdsb2024>
 
 - Día 1: Flujo de trabajo orientado a proyectos:
-  - Introducción al flujo de trabajo orientado a proyectos.
+  - Introducción al trabajo con proyectos de RStudio.
   - Paths seguros.
-  - Buenas prácticas de configuración y mantenimiento de espacios de trabajo.
-  - Modificando los archivos de inicio de R.
-  - Nuevas funcionalidades de RStudio, Quarto.
-
-- Día 2: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte I
   - Control de versiones con GitHub y RStudio. 
   - Solución de problemas con las versiones de paquetes de Rstudio.
+
+- Día 2: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte I
+
   - Infraestructura de un paquete de R/Bioconductor.
-  - Plática: Convirtiendo tu flujo de análisis en un paquete de R/Bioconductor.
   - Documentación de funciones.
   - Sesión social: Conociendo a la comunidad.
+  - Proyectos colaborativos Parte I.
 
 - Día 3: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte II
   - Diseño de pruebas.
   - Creación de viñetas.
   - Compilación e instalación de paquetes.
-  - Proyectos colaborativos Parte I.
+  - Proyectos colaborativos Parte II.
 
-- Día 4:  Proyectos colaborativos
-  - Proyectos colaborativos Parte II. 
+- Día 4: Creación de sitios web para la documentación de paquetes de R
+  - Creación de sitios web con pkgdown 
+  - Proyectos colaborativos Parte III. 
   - Presentación de proyectos.
   - Clausura.
 

docs/404.html

@@ -138,9 +138,10 @@
 <li class="chapter" data-level="" data-path="index.html"><a href="index.html"><i class="fa fa-check"></i>Bienvenida</a>
 <ul>
 <li class="chapter" data-level="0.1" data-path="index.html"><a href="index.html#instructores"><i class="fa fa-check"></i><b>0.1</b> Instructores</a></li>
-<li class="chapter" data-level="0.2" data-path="index.html"><a href="index.html#temario"><i class="fa fa-check"></i><b>0.2</b> Temario</a></li>
-<li class="chapter" data-level="0.3" data-path="index.html"><a href="index.html#patrocinadores"><i class="fa fa-check"></i><b>0.3</b> Patrocinadores</a></li>
-<li class="chapter" data-level="0.4" data-path="index.html"><a href="index.html#licencia"><i class="fa fa-check"></i><b>0.4</b> Licencia</a></li>
+<li class="chapter" data-level="0.2" data-path="index.html"><a href="index.html#ayudantes"><i class="fa fa-check"></i><b>0.2</b> Ayudantes</a></li>
+<li class="chapter" data-level="0.3" data-path="index.html"><a href="index.html#temario"><i class="fa fa-check"></i><b>0.3</b> Temario</a></li>
+<li class="chapter" data-level="0.4" data-path="index.html"><a href="index.html#patrocinadores"><i class="fa fa-check"></i><b>0.4</b> Patrocinadores</a></li>
+<li class="chapter" data-level="0.5" data-path="index.html"><a href="index.html#licencia"><i class="fa fa-check"></i><b>0.5</b> Licencia</a></li>
 </ul></li>
 <li class="chapter" data-level="1" data-path="trabajando-con-proyectos-de-rstudio.html"><a href="trabajando-con-proyectos-de-rstudio.html"><i class="fa fa-check"></i><b>1</b> Trabajando con proyectos de RStudio</a>
 <ul>
@@ -238,13 +239,17 @@
 <li class="chapter" data-level="9.8" data-path="compilación-e-instalación-de-paquetes.html"><a href="compilación-e-instalación-de-paquetes.html#instalando-un-paquete-local"><i class="fa fa-check"></i><b>9.8</b> Instalando un paquete local</a></li>
 <li class="chapter" data-level="9.9" data-path="compilación-e-instalación-de-paquetes.html"><a href="compilación-e-instalación-de-paquetes.html#contribuyendo-código"><i class="fa fa-check"></i><b>9.9</b> Contribuyendo código</a></li>
 </ul></li>
-<li class="chapter" data-level="10" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html"><i class="fa fa-check"></i><b>10</b> Proyectos colaborativos</a>
+<li class="chapter" data-level="10" data-path="creación-de-sitios-web-con-pkgdown.html"><a href="creación-de-sitios-web-con-pkgdown.html"><i class="fa fa-check"></i><b>10</b> Creación de sitios web con pkgdown</a>
 <ul>
-<li class="chapter" data-level="10.1" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html#propuesta-1"><i class="fa fa-check"></i><b>10.1</b> Propuesta 1</a></li>
-<li class="chapter" data-level="10.2" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html#propuesta-2"><i class="fa fa-check"></i><b>10.2</b> Propuesta 2</a></li>
-<li class="chapter" data-level="10.3" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html#propuesta-3"><i class="fa fa-check"></i><b>10.3</b> Propuesta 3</a></li>
-<li class="chapter" data-level="10.4" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html#propuesta-4"><i class="fa fa-check"></i><b>10.4</b> Propuesta 4</a></li>
-<li class="chapter" data-level="10.5" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html#propuesta-5"><i class="fa fa-check"></i><b>10.5</b> Propuesta 5</a></li>
+<li class="chapter" data-level="10.1" data-path="creación-de-sitios-web-con-pkgdown.html"><a href="creación-de-sitios-web-con-pkgdown.html#diapositivas-9"><i class="fa fa-check"></i><b>10.1</b> Diapositivas</a></li>
+</ul></li>
+<li class="chapter" data-level="11" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html"><i class="fa fa-check"></i><b>11</b> Proyectos colaborativos</a>
+<ul>
+<li class="chapter" data-level="11.1" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html#propuesta-1"><i class="fa fa-check"></i><b>11.1</b> Propuesta 1</a></li>
+<li class="chapter" data-level="11.2" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html#propuesta-2"><i class="fa fa-check"></i><b>11.2</b> Propuesta 2</a></li>
+<li class="chapter" data-level="11.3" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html#propuesta-3"><i class="fa fa-check"></i><b>11.3</b> Propuesta 3</a></li>
+<li class="chapter" data-level="11.4" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html#propuesta-4"><i class="fa fa-check"></i><b>11.4</b> Propuesta 4</a></li>
+<li class="chapter" data-level="11.5" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html#propuesta-5"><i class="fa fa-check"></i><b>11.5</b> Propuesta 5</a></li>
 </ul></li>
 </ul>
 

docs/compilación-e-instalación-de-paquetes.html

@@ -30,7 +30,7 @@
 
 
 <link rel="prev" href="creación-de-viñetas.html"/>
-<link rel="next" href="proyectos-colaborativos-1.html"/>
+<link rel="next" href="creación-de-sitios-web-con-pkgdown.html"/>
 <script src="libs/jquery-3.6.0/jquery-3.6.0.min.js"></script>
 <script src="https://cdn.jsdelivr.net/npm/[email protected]/dist/fuse.min.js"></script>
 <link href="libs/gitbook-2.6.7/css/style.css" rel="stylesheet" />
@@ -138,9 +138,10 @@
 <li class="chapter" data-level="" data-path="index.html"><a href="index.html"><i class="fa fa-check"></i>Bienvenida</a>
 <ul>
 <li class="chapter" data-level="0.1" data-path="index.html"><a href="index.html#instructores"><i class="fa fa-check"></i><b>0.1</b> Instructores</a></li>
-<li class="chapter" data-level="0.2" data-path="index.html"><a href="index.html#temario"><i class="fa fa-check"></i><b>0.2</b> Temario</a></li>
-<li class="chapter" data-level="0.3" data-path="index.html"><a href="index.html#patrocinadores"><i class="fa fa-check"></i><b>0.3</b> Patrocinadores</a></li>
-<li class="chapter" data-level="0.4" data-path="index.html"><a href="index.html#licencia"><i class="fa fa-check"></i><b>0.4</b> Licencia</a></li>
+<li class="chapter" data-level="0.2" data-path="index.html"><a href="index.html#ayudantes"><i class="fa fa-check"></i><b>0.2</b> Ayudantes</a></li>
+<li class="chapter" data-level="0.3" data-path="index.html"><a href="index.html#temario"><i class="fa fa-check"></i><b>0.3</b> Temario</a></li>
+<li class="chapter" data-level="0.4" data-path="index.html"><a href="index.html#patrocinadores"><i class="fa fa-check"></i><b>0.4</b> Patrocinadores</a></li>
+<li class="chapter" data-level="0.5" data-path="index.html"><a href="index.html#licencia"><i class="fa fa-check"></i><b>0.5</b> Licencia</a></li>
 </ul></li>
 <li class="chapter" data-level="1" data-path="trabajando-con-proyectos-de-rstudio.html"><a href="trabajando-con-proyectos-de-rstudio.html"><i class="fa fa-check"></i><b>1</b> Trabajando con proyectos de RStudio</a>
 <ul>
@@ -238,13 +239,17 @@
 <li class="chapter" data-level="9.8" data-path="compilación-e-instalación-de-paquetes.html"><a href="compilación-e-instalación-de-paquetes.html#instalando-un-paquete-local"><i class="fa fa-check"></i><b>9.8</b> Instalando un paquete local</a></li>
 <li class="chapter" data-level="9.9" data-path="compilación-e-instalación-de-paquetes.html"><a href="compilación-e-instalación-de-paquetes.html#contribuyendo-código"><i class="fa fa-check"></i><b>9.9</b> Contribuyendo código</a></li>
 </ul></li>
-<li class="chapter" data-level="10" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html"><i class="fa fa-check"></i><b>10</b> Proyectos colaborativos</a>
+<li class="chapter" data-level="10" data-path="creación-de-sitios-web-con-pkgdown.html"><a href="creación-de-sitios-web-con-pkgdown.html"><i class="fa fa-check"></i><b>10</b> Creación de sitios web con pkgdown</a>
 <ul>
-<li class="chapter" data-level="10.1" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html#propuesta-1"><i class="fa fa-check"></i><b>10.1</b> Propuesta 1</a></li>
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+<li class="chapter" data-level="10.1" data-path="creación-de-sitios-web-con-pkgdown.html"><a href="creación-de-sitios-web-con-pkgdown.html#diapositivas-9"><i class="fa fa-check"></i><b>10.1</b> Diapositivas</a></li>
+</ul></li>
+<li class="chapter" data-level="11" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html"><i class="fa fa-check"></i><b>11</b> Proyectos colaborativos</a>
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+<li class="chapter" data-level="11.1" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html#propuesta-1"><i class="fa fa-check"></i><b>11.1</b> Propuesta 1</a></li>
+<li class="chapter" data-level="11.2" data-path="proyectos-colaborativos-1.html"><a href="proyectos-colaborativos-1.html#propuesta-2"><i class="fa fa-check"></i><b>11.2</b> Propuesta 2</a></li>
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 </ul></li>
 </ul>
 
@@ -401,7 +406,7 @@ <h2><span class="header-section-number">9.9</span> Contribuyendo código<a href=
         </div>
       </div>
 <a href="creación-de-viñetas.html" class="navigation navigation-prev " aria-label="Previous page"><i class="fa fa-angle-left"></i></a>
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   </div>
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