Skip to content

pojdulos/readNRRD

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 

History

16 Commits
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

readNRRD

konwertuje dane wolumetryczne z bazy PDDCA w formacie .nrrd do postaci akceptowalnej przez Detectron

Program w oparciu o zawartość pliku img.nrrd generuje pliki graficzne (domyślnie .jpg) oraz tworzy plik opisu via_region_data.json

PRZED UŻYCIEM

Aby ustawić poprawne scieżki dostępu należy w pliku consts.py zmodyfikować stałe SRC_ROOT oraz DST_ROOT według swoich potrzeb.

Opis jest tworzony tylko dla jednej wysegmentowanej struktury (domyślnie żuchwy: 'Mandible'). Można wybrać inna strukturę modyfikując w pliku consts.py stałą SEGMENTED_STRUCTURE. Należy jej przypisać nazwę odpowiedniego pliku z katalogu SRC_ROOT/{sample}/structures bez rozszerzenia.

About

No description, website, or topics provided.

Resources

License

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published

Languages