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python3.7, pillow, tqdm, torchfile, pytorch1.1+ (for inference)
pip install pillow pip install tqdm pip install torchfile conda install pytorch==1.1.0 torchvision==0.3.0 -c pytorch
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接下来克隆这个仓库:
git clone https://github.com/rnzhiw/HuaweiCupMathModel.git
- 第一问采用随机森林+相关性分析筛选20个变量
- 第二问采用决策树回归、线性回归、梯度提升向量机、随机 森林回归、多层次感知机回归、XGBoost 回归和LightGBM 模型对生物活性预测。最终得出LightGBM 模型的效果比较好
- 第三问采用多层感知机(MLP)对化合物的 ADMET 性质进行预测。训练集采用90%的样本,测试集采用10%的样本。五种性质的平均准确率为90.5%
- 第四问采用改进型贪心调优
第三问的模型结构彩图
介绍
在该问题中,学习率为0.01的时候有比较好的效果,准确率达到了90.5%,使用了Dropout、Dice Loss、Adam 优化器、Poly 学习率衰减和 Kaiming 初始化。
接下来是模型在lr=0.01的情况下的五种性质预测准确率图:
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